電影: Kazuhiko Inoue

故事發生在日本千年一遇的流星夜後一個月。住在鄉郊的女高中生宮水三葉對這種生活感到枯燥，一直非常嚮往都市生活。「來生要成為東京帥哥！」是她的願望。有一天，她真的夢見自己成為男生。眼前的是一個不熟悉的房間、不認識的朋友，還有她夢寐以求的東京寬闊街道。 另一邊廂，在東京生活的男子高校生立花瀧也有一個奇特夢境。夢中，他來到一個未見過的山中小町，發現自己變成一個女高中生！「我們的身分交換了？！」兩位從未見面的二人相遇，一段少女、少年奇妙物語隨之展開。...

本片發生的主要時間是「第四次忍界大戰」兩年後的故事，講述鳴人和雛田的愛情發生經過。另外，第五代火影千手綱手已卸任，由旗木卡卡西繼任第六代火影。 故事初期雛田偷偷織了一條圍巾，打算織給鳴人，可是一直沒有一個合適的機會送給鳴人。就在此時，來自月球之祖·大筒木羽村的後裔大筒木捨人突然出現在雛田眼前，並留下一句話。在捨人留下那句説話後，隕石就伴隨著強烈的光芒貫穿了夜空，一眾五影也發現月球異常接近地球，於是五影會談緊急召開，討論如何制止月球的行動。不久，第六代火影旗木卡卡西向由鳴人、小櫻、鹿丸、雛田和祭...

長野縣．八嶽聯峰未寶嶽。長野縣警大和敢助在雪山追捕「某名男子」時，一抹身影突然映入他的眼簾。在他分心的瞬間，「某名男子」擊出的步槍子彈擦過敢助的左眼，地面轟然雷動，雪崩隨之發生，直接將敢助吞沒—— 10 個月後。國立天文台野邊山所屬設施的研究人員遭到不明人士襲擊，接獲通報後，從雪崩中奇蹟生還的敢助與上原由衣立即趕往現場。在他們進行調查途中，天文台的巨型鑊形天線啟動時，因負傷而變成獨眼的敢助，左眼突然無故劇烈地疼痛起來…… 當天晚上，毛利偵探事務所接到了小五郎任職警視廳時交情好的同事，被稱為「鱷魚...

有一天，少女明日菜從父親遺物裏的礦石收音機中聽到不可思議的音樂。那如人心靈般的音樂，令明日菜難以忘懷。在前往山丘的途中，明日菜被怪異的怪獸所襲擊，並被一名叫瞬的少年所救。瞬是為了看見一直想要遇見到的人和物，從遙遠的雅戈泰而來。就在兩人日漸心靈相通之時，瞬突然於明日菜的生命裏面消失了。 明日菜被告知哀痛的消息後，學校的新任教師森崎龍司於校裏講述了有關地下世界的神話。那裏隱藏的秘密，就是所謂實現願望的地方，被稱為「雅戈泰」。在此同時，明日菜面前出現了跟瞬長得一模一樣的少年，還有一眾追捕少年的人。那...

十幾年前，帶著面具的神秘忍者 (宇智波帶土) 解放了巨大的魔獸「九尾」，被九尾襲擊而面臨毀滅的木葉村，為了守護村子，第四代火影犧牲自己的性命，把九尾封印在剛出生的孩子鳴人身上。而時光流逝，令人恐懼的忍者集團「曉」的成員襲擊了木葉村，而鳴人與夥伴們也勉強的算是迎擊成功。但是原本應該已經死去的「曉」的成員，突然間再次出現，並襲擊了木葉忍者村；鳴人等人將之擊退後受到村人的讚許，同時也獲得了提交上忍申請書的機會。看到其他人都有父母可以幫忙寫申請書而感到落寞和焦躁的鳴人，以及對父母的囉嗦與管教感到不滿的小...

漩渦慕留人雖然身為木葉英雄—第七代火影漩渦鳴人的兒子，但慕留人卻並沒因為這樣而喜歡父親。慕留人希望將父親鳴人完全否定，並且有著超越其父的想法，於是懇求身為父親永遠對手的宇智波佐助收他為徒，決定寫出屬於自己的新一頁，讓父親對他另眼相看。中忍考試，慕留人因受到科學家方助教唆，使用違禁品—科學忍具比賽，想讓父親看清楚他的本領。然而，發現這一切的鳴人卻當場判定慕留人敗北，並取消他的中忍資格。村子遭遇危機，忍術對敵人無效，使鳴人佐助煩惱。這時，佐助想起了慕留人那會隱形的螺旋丸，要慕留人對敵人使出螺旋丸。可...

位於東京．八丈島近海的海洋設施「太平洋浮標」，其建造目的在聯結全球警察的監控鏡頭。 因應正式營運，為了聯上歐洲的警察組織．歐洲刑警組織管轄的網路，世界各國的工程師紛紛齊聚一堂。某項運用人臉識別系統的「新技術」也在那裏進行測試——。 另一方面，柯南等少年偵探團一行人受園子之邀前往八丈島賞鯨。然而隨後卻接到了沖矢昴（赤井秀一）的電話，告知他歐洲刑警組織的職員在德國慘遭琴酒殺害。感到不安的柯南，躲進前往「太平洋浮標」警戒的黑田兵衞等警視廳相關人員搭乘的警備艇，潛入設施內。豈料，在為了系統運作而逐步...

故事時間點則相當於 TV 版的 Session#22～23 之間。 2071 年，即將迎接萬聖節的火星都市「阿路巴城」（片中有出現該城中文路標，以其為準。）。在高速道路上一輛油罐車突然發生了爆炸，而在案發現場周邊的人們，卻也出現了原因不明的症狀相繼倒地，造成相關死傷者高達 400 人以上的慘案。警方認為這可能是使用不明生化武器的恐怖活動，火星政府也發出 3 億烏隆的高額賞金緝兇。而在追查另一件盜刷貨幣卡案件的駭客嫌犯李·山森的菲，卻意外拍到了案發當時，現場所出現的一名手掌上有刺青的男子。為了 ...

在神秘委託者的招待下，小五郎與柯南一行人來到了橫濱。一行人受邀來到一座遊樂園，沒想到卻掉入黑影的神秘男子所設下的陷阱。小蘭、灰原與少年偵探團，也因此落入敵人手中成為人質。時間限制為 12 個小時，如果不在時間內解開男子所出的謎題，小蘭他們身上的炸彈就會爆炸。 這名男子居然知道柯南其實就是工藤新一？！這名男子的真正身份，難道是……就在同時，「關西的高中生偵探」服部平次的兒時玩伴和葉也被抓走成為了人質。追查著怪盜基德的「高中偵探始祖」白馬探，也接到了神秘男子的委託。這些偵探們將與柯南一同挑戰謎題。但...

以東京為中心發生六件大範圍的聯續殺人事件，引起警政高層的重視，柯南意外地發現「黑色組織」涉及整個事件! 如果他們知道工藤新一還活著的話，那麼新一與柯南的夥伴們會不會一併遭到追殺? ! 知道事態危險的柯南又如何獨自展開搜查. ....

以 635 米的高度為傲、可以俯瞰東京街景的鈴木塔（註：以現實中 634 米的東京晴空塔為原型）竣工。前往參加其開幕儀式的柯南等人，從眺望台上享受著絕美的景色。就在此時，一發子彈擊碎了窗戶玻璃，打穿了一個男人的胸膛。案件發生於一瞬之間，完全搞不清到底發生了什麼，小蘭與少年偵探團都陷入了恐慌。 柯南立刻利用追蹤眼鏡的望遠鏡功能，沿著彈道發現了一個黑色的身影。「從那麼遠的距離進行狙擊，怎麼可能？！」柯南馬上與女高中生偵探世良真純乘坐摩託車追趕逃走的狙擊手，意想不到的是狙擊手居然聯警察的巡邏車都打算...

兩年前，10 歲的天才少年澤田弘樹在完成人工智慧後墜樓身亡。兩年後的某一天，眾多政商名流來到米花市政大樓。這裏正在舉行能夠一舉改變全世界遊戲業界價值觀的模擬遊戲機「繭」的發表會。他們的子女全都受邀參加。玩家可透過這個遊戲，進入虛擬世界中，體驗實地遊玩遊戲的快感。結合最先進技術的「繭」，其遊戲方式是先進入一部外型酷似蠶繭的大型膠囊，透過電腦操作讓遊戲者沉睡於歷史上曾經發生過事件的年代，並進行挑戰的虛擬體驗遊戲。 柯南、灰原及少年偵探團成員們也接獲邀請，前往參加這場受到全世界矚目的發表會，並陰錯陽...

毛利偵探事務所突然接到一通威脅電話，路上的汽車就在小五郎的眼前爆炸了。「藍色的少年與藍色的斑馬，從天而降的雨……」——根據犯人寄來的挑戰書，若不能解讀謎之暗號，便無法阻止接下來的爆炸。小五郎和毛利蘭在米花市內來回奔走，卻完全找不到破解暗號的方法。而正當柯南與灰原哀和少年偵探團一起、沉浸在觀看最愛的足球比賽的快樂之中的時候，得知了威脅電話的事情，為瞭解讀暗號柯南獨自一人離開了球場，卻得知了無人能夠阻止的恐怖事實。...

某一天，毛利偵探事務所接到了知名舞台劇女演員牧樹里的委託。委託內容是關於怪盜基德的預告信，信中指出怪盜基德將在舞台上奪取牧樹里佩帶的藍寶石戒指——「命運的寶石」。在劇場裏錯綜複雜的人羣中，怪盜基德到底會假扮成誰出現在大家面前？不過，「命運的寶石」終究是保護住了，牧樹里為了表示感謝，邀請毛利偵探前往北海道函館的別墅度假。就在大家都搭上飛機前往函館的機艙裏，一幕精心設計的殺人劇碼就在大家面前實際上演了。江戶川柯南除了要防止怪盜基德再度混入人羣中，又要解開發生在飛機上的密室殺人事件，到底江戶川柯南要怎...

住在青森的中學三年級生「浩紀」與「拓也」，夢想着能夠到「神秘巨塔」所在的海峽對岸去。於是兩個人為了實現夢想而開始製造名為「貝勒斯拉」（Velaciela，音近維拉切拉，意為白色之翼）的飛機。 兩人的同班同學「澤渡佐由理」在因緣牽絆下遇見了浩紀與拓也兩人，並對於他們要在暑假搭乘貝勒斯拉到神秘巨塔的計劃非常的寄予厚望，也和浩紀許下一起搭乘貝勒斯拉到海峽對岸去的約定；佐由理因此成為了浩紀與拓也兩人完成夢想不可或缺的女孩。 在此之後，佐由理在沒告知兩人的情況下就突然地轉學並從此下落不明。受到此一打擊...

開場由警官驅車追捕兩個搶超市的罪犯，佐藤美和子警官用高超的駕駛技術迫使罪犯的汽車翻車，當問及作案動機時，罪犯吐出在神海島上有「Jolly Roger」。 而柯南他們前往位於太平洋中的美麗小島「神海島」渡假。這座島嶼自古流傳著一則有關於沉沒在海底的古代遺跡「海底宮殿」，以及300年前實際存在的女海盜「安·寶尼」、「瑪麗·麗德」所遺留下來的寶藏傳說。 在毛利小五郎的帶領下，小五郎、小蘭、園子、阿笠博士、少年偵探團一行人來到神海島。小蘭與園子在海底宮殿附近海底潛水，少年偵探團則在玩神海島觀光安排的...

東京澀谷街頭充滿萬聖節的熱鬧氣氛。 在澀谷HIKARIE正舉行婚禮，披上婚紗現身的新娘正是警視廳的佐藤警官。當柯南及賓客們獻上祝賀時，一名男子突然闖入婚宴鬧事，高木警官為了保護大家的安全，奮不顧身上前制止，雖然事件平安落幕，然而在佐藤警官眼裡並非如此，３年前發生的連續爆炸事件，使得當時愛慕的松田警官因公殉職，當時出現在佐藤眼中的死神身影竟然再次重疊在高木身上。 同一時間，連續爆炸事件的犯人在此時逃獄。公安警察—降谷零(安室透)對於將自己同期的松田送上黃泉路的兇手緊追不捨，卻被謎樣的變裝人物裝上項...

戰爭混亂加劇。帶領 AEUG 的古華多羅、企圖將泰坦斯佔為己有的希羅克，以及高舉復興薩比家旗幟的自護軍殘黨阿古捷斯首領哈曼這三股勢力互相牽制。最終使得戰局向著圍繞著宇宙殖民衞星格利普斯 2 號進發。另一方面，蕾科亞·倫德離開了 AEUG，投靠向了泰坦斯的希羅克。而另一邊在仰慕希羅克的同時，也被 AEUG 的嘉美尤等人所吸引的還有莎拉·撒比亞羅夫。接受了她們的想法，嘉美尤駕駛著 Z 高達在混亂的戰場上飛行。 故事的總體走向與電視版的大致相同。刪掉了其中的幾集故事內容，相比於在電視劇版中嘉美尤反抗...

在半個月前，八代造船的的船舶設計人八代英人在駕駛時心臟病發，墜落懸崖身亡。不同年代的2個事件，是將豪華客船的乘務員與乘客捲入巨大陰謀的序章。 由於園子的邀請，柯南一行人受邀參與豪華客船「亞芙羅蒂號」的處女航儀式。一行人開心的參觀郵輪。一行人開始在船內玩起捉迷藏。可是在捉迷藏進行中時，園子突然被人綁架監禁了起來。透過柯南的推理，平安地救出了園子。但這次，八代造船的社長——八代貴江被人刺殺，會長八代延太郎也失去下落。目暮警官們抵達後開始了搜查。雖說嫌疑犯包含乘務員與乘客等多達600名，但搜查勢在必...

朝倉都知事收到一封神秘的恐嚇信，內容為：「對於你那4年執政中桀驁不馴的態度，上天將給予懲罰！」。隔天，由都知事主導開通的新地下鐵隧道遭到炸毀。雖然多虧柯南知道恐嚇信而使得這次爆破事件沒有人員傷亡，但是奪取都知事性命失敗的犯人勢必將再次犯案，並帶來更大的災害，調查朝倉都知事歷年事政的柯南，察覺到極有可能是在國土交通大臣時代所推動的水庫建設案中，懷有恨意的犯人就在那相關關係人等之中，因此決定進行深度搜查。 因為水庫的建造，沉入湖底的新潟縣北之澤村村民遷移到鄰近土地已有5年了，在這5周年紀念的日子裏...